เมื่อวันที่ 12 ม.ค.69 กระทรวงการต่างประเทศ ออกแถลงการณ์ ยืนยันประเทศไทยเคารพและปฏิบัติตามข้อตกลงต่าง ๆ ระหว่างไทยกับกัมพูชาอย่างเคร่งครัดมาโดยตลอด และขอประท้วงข้อกล่าวหาของกัมพูชาว่าไทยเข้ายึดครองและปฏิบัติการทางทหารในหลายพื้นที่ของกัมพูชาภายหลังการบรรลุข้อตกลงหยุดยิง โดยการคงกำลังทหารที่มีอยู่ในพื้นที่ปัจจุบัน ภายหลังการหยุดยิงเป็นไปตามข้อ 2 ของถ้อยแถลงร่วมฯ และไม่อาจตีความได้ว่าเป็นการยึดครองดินแดน ฝ่ายไทยจึงขอปฏิเสธข้อกล่าวหาที่ไม่มีมูลของกัมพูชาว่าไทยผนวกดินแดนกัมพูชาโดยมิชอบ และเรียกร้องให้กัมพูชายุติการเผยแพร่ข้อกล่าวหาดังกล่าวที่บ่อนทำลายบรรยากาศที่เอื้อต่อการเจรจาโดยสันติโดยทันที

ฝ่ายไทยยังคงยึดมั่นในกระบวนการสำรวจและจัดทำหลักเขตแดนทางบกร่วมกับฝ่ายกัมพูชา โดยอาศัยคณะกรรมาธิการเขตแดนร่วม (JBC) เป็นกลไกหลักในการพิจารณาประเด็นด้านกฎหมายและเทคนิค ทั้งนี้ การดำเนินการเรื่องเขตแดนควรอยู่ภายใต้บรรยากาศที่ไม่ตึงเครียดและอยู่บนพื้นฐานของความไว้เนื้อเชื่อใจ ไทยจึงขอเรียกร้องให้กัมพูชาดำเนินมาตรการลดความตึงเครียดตามที่ระบุไว้ในถ้อยแถลงร่วมฯ โดยเฉพาะการเก็บกู้ทุ่นระเบิดเพื่อมนุษยธรรม เพื่อประกันความ

โดยที่ปัจจุบันไทยอยู่ระหว่างการดำเนินกระบวนการภายใน ซึ่งจำเป็นต้องรอการจัดตั้งรัฐบาลชุดใหม่ภายหลังการเลือกตั้งทั่วไป ฝ่ายไทยจะเสนอกำหนดวันจัดประชุม JBC ครั้งถัดไป พร้อมร่างระเบียบวาระการประชุม ให้ฝ่ายกัมพูชาทราบต่อไป