วันที่ 7 ม.ค.67 พลตำรวจตรีวัชรินทร์ พูสิทธิ์ ผู้บังคับการ กองบังคับการปราบปรามการกระทำความผิดเกี่ยวกับทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม พันตำรวจเอกมงคล พรานสูงเนิน รอง ผู้บังคับการ พันตำรวจเอก อภิสัณฐ์ ไชยรัตน์ ผู้กำกับการ 5 สั่งการให้ชุดปฏิบัติการเข้าสืบสวนติดตามจับกุมตัวพระครูปลัดอรุณ ซึ่งตกเป็นผู้ต้องหาตามหมายจับของศาลจังหวัดลำปางที่ ฝ.854/2557 ลงวันที่ 19 สิงหาคม 2557 ในคดีอนาจาร โดยผู้เสียหายเป็นสามเณร และผู้ต้องหารายนี้ได้มีพฤติการหลบหนีไม่มารายงานตัวต่อศาลตามกำหนดนัด จึงถูกออกหมายจับกุม เจ้าหน้าที่สืบสวนจนพบว่า พระครูปลัดอรุณ ได้หลบหนีจากจังหวัดลำปางท้องที่เกิดเหตุกลับมายังจังหวัดสงขลา และเดินทางต่อมาจำวัดอยู่ที่วัดอัมพวัน หมู่ 4 ตำบลเกาะพงัน อำเภอเกาะพงัน จังหวัดสุราษฎร์ธานี

เจ้าหน้าที่ได้เข้าติดตามจนพบว่าพระครูปลัดอรุณ พำนักอยู่ในกุฎิภายในวัดจึงเข้าแสดงตัวและขอให้พระครูปลัดอรุณแสดงเอกสารประจำตัว พบว่าเป็นบุคคลคลเดียวกันเจ้าหน้าที่จึงแสดงหมายจับกุม และอ่านหมายจับกุมแจ้งข้อกล่าวหาให้รับทราบ โดยพระปลัดอรุณ รับว่าเป็นบุคคลเดียวกันและไม่เคยถูกจับกุมตามหมายจับนี้มาก่อน แต่ขอปฏิเสธตลอดข้อกล่าวหา เจ้าหน้าที่ได้แจ้งการปฏิบัติตามหมายจับของศาลผู้ต้องหาสามารถต่อสู้คดีได้ หลังจากนั้นจึงทำบันทึกจับกุมและคุมตัวพระครูปลัดส่งไปยังศาลจังหวัดลำปาง เพื่อดำเนินคดี

สำหรับเหตุการณ์ที่นำไปสู่การออกหมายจับนั้นพระครูปลัดอรุณ ให้การว่าบวชตั้งแต่เมื่อปี 2541ขณะเกิดเหตุเมื่อราวปี 2556 ได้เรียนจบ ป.ตรี พุทธศาสตร์ หลังจากนั้นได้เลยมาที่วัดแห่งหนึ่ง ในจังหวัดลำปาง (สถานที่เกิดเหตุ) เพื่อมาเยี่ยมพระสงฆ์ที่เรียนรุ่นเดียวกัน เลยได้ช่วยสอนหนังสือสามเณรที่วัดซึ่งวัดเป็นโรงเรียนสามเณรเรียน ม.1-ม.6  วันเกิดเหตุทางวัดจัดกิจกรรมไหว้ครูให้การว่าเด็กๆ ไหว้เสร็จก็เข้ามากอดมาเล่นด้วย ต่อมาประมาณ 1 สัปดาห์หลังจากวันไหว้ครูปีนั้น ได้มีผู้ปกครองของสามเณรมาพร้อมกับมูลนิธิช่วยเหลือเด็กชาวเขาได้เข้ามาที่วัดและมากล่าวหาบอกว่าได้ทำอนาจารโดยการจับอวัยวะเพศของสามเณร (เป็นเด็กเผ่าม้ง) จากจังหวัดเชียงราย โดยเจ้าหน้าที่ตำรวจได้รับเป็นคดีเมื่อ 27 มิถุนายน 2557 หลังจากนั้นไม่นานได้เดินทางออกจากพื้นที่โดยที่ไม่รู้ว่ามีหมายจับจนกระทั่งถูกจับและขอให้การปฏิเสธเนื่องจากไม่เป็นความจริงตามที่ถูกแจ้งข้อกล่าวหา