กองบัญชาการตำรวจสอบสวนกลาง (CIB) โดย กองบังคับการปราบปราม (บก.ป.) ภายใต้การอำนวยการของพล.ต.ท.จิรภพ ภูริเดช ผบช.ก. สั่งการให้ พล.ต.ต.มนตรี เทศขัน ผบก.ป., พ.ต.อ.พัฒนศักดิ์ บุบผาสุวรรณ, พ.ต.อ.พรศักดิ์ เลารุจิราลัย รอง ผบก.ป. ,พ.ต.อ.พงศ์ปณต ชูแก้ว ผกก.6 บก.ป, พ.ต.ท.อนุสรณ์ ทองไสย,พ.ต.ท.ศิลป์ชัย ถวัลย์ภิยโย, พ.ต.ท.กันตเมศฐ์ อัครโชควรานนท์, พ.ต.ท.วริศร มัจฉา รอง ผกก.6 บก.ป. เจ้าหน้าที่ชุดจับกุม นำโดย พ.ต.ท.ทศพล กิติลาภ สว.กก.๖ บก.ป., ร.ต.ท.ชัยยุทธ์ พรหมจินดา รอง สว.กก.6 บก.ป. พร้อมด้วยเจ้าหน้าที่ตำรวจ กก.๖ บก.ป. ชุดปฏิบัติการจังหวัดสงขลา

ได้ร่วมกันจับกุม  นายยงยุทธฯ อายุ 38 ปี ผู้ต้องหาตามหมายจับของศาลจังหวัดสงขลา ที่ 376/2547 ลงวันที่ 1 เมษายน 2547 ซึ่งต้องหาว่ากระทำความผิดฐาน “ร่วมกันพยายามฆ่าผู้อื่นโดยไตร่ตรองไว้ก่อน”สถานที่จับกุม บริเวณหน้าบ้านหลังหนึ่ง ในพื้นที่ ต.ควนทอง อ.ขนอม จ.นครศรีธรรมราช

พฤติการณ์  สืบเนื่องจากเมื่อวันที่ 1 พฤศจิกายน 2546 เวลากลางคืน นายยงยุทธ ฯ  และเพื่อน ได้นั่งดื่มสุราอยู่ที่ร้านเหล้าแห่งหนึ่งใน อ.หาดใหญ่ จ.สงขลา ต่อมา นายยงยุทธฯ กับพวก ได้พบกับกลุ่มวัยรุ่นคู่อริ และได้เกิดการทะเลาะวิวาท มีปากเสียงกันขึ้น ก่อนที่เพื่อนของนายยงยุทธฯ จะใช้อาวุธปืนขนาด 9 มม.ยิงถูกคู่อริที่ท้องจำนวน 1 นัด ได้รับบาดเจ็บสาหัส จากนั้นทั้งคู่จึงได้หลบหนีไปด้วยกันด้วยรถจักรยานยนต์ โดยมีนายยงยุทธฯ เป็นผู้ขับขี่ ต่อมาเจ้าหน้าที่ตำรวจสอบสวน สภ.หาดใหญ่ จ.สงขลาได้รวบรวมพยานหลักฐานกระทั่งศาลออกหมายจับนายยงยุทธฯ และเพื่อน รวม 2 คน ซึ่งเพื่อนของนายยงยุทธฯ ได้ถูกจับกุมไปก่อนหน้านี้แล้ว เหลือแต่นายยงยุทธฯ ผู้ต้องหารายนี้ที่ยังคงอยู่ระหว่างการหลบหนี  กระทั่งเจ้าหน้าที่ตำรวจกองปราบปราม สืบสวนและติดตามจับกุมไว้ได้ดังกล่าว ก่อนนำตัวส่งพนักงานสอบสวน สภ.หาดใหญ่ ดำเนินคดีตามกฎหมายต่อไป

สอบถามคำให้การผู้ต้องหาเบื้องต้น ให้การรับสารภาพว่าร่วมกับเพื่อนก่อเหตุยิงคู่อริได้รับบาดเจ็บจริง โดยหลังจากหนีออกมาจากบริเวณที่เกิดเหตุด้วยกันแล้วก็ได้แยกย้ายกันหลบหนี โดยนายยงยุทธฯ หลบหนีการจับกุมไปอยู่ในหลายพื้นที่ได้แก่นครศรีธรรมราช ภูเก็ต ชลบุรี เพื่อรอคดีขาดอายุความ เมื่อเห็นว่าใกล้จะขาดอายุความและน่าจะไม่มีเจ้าหน้าที่ตำรวจติดตามแล้ว จึงได้กลับมาหางานทำอยู่ อ.ขนอม จ.นครศรีธรรมราช ก่อนจะมาถูกจับกุมตัวได้ ก่อนคดีจะขาดอายุความเพียง 5 วัน ใช้เวลาหลบหนี 19 ปี